Un sistema GC consta de varios componentes y el papel de cada componente es crítico para obtener una buena separación y análisis. 

La espectrometría de masas (MS) es una técnica de detección altamente sensible que forma, separa y detecta iones en fase gaseosa. Cuando se acopla a un GC, ioniza inmediatamente los compuestos gaseosos eluidos, separa los iones al vacío en función de sus relaciones masa-carga (m/z) y, finalmente, mide la intensidad de cada ion.